期刊详情 INFORMATION
刊名：山西医科大学学报
主管：山西省教育厅
主办：山西医科大学
主编：郭政
周期：月刊
语种：中文
出版地：山西省太原市
开本：16开
ISSN：1007-6611
CN： 14-1216/R
邮发代号：22-11
复合影响因子：0.434
综合影响因子：0.316
被以下数据库收录
获奖情况：
中国科技类核心期刊
中国科技论文统计源期刊
美国CA源期刊
俄罗斯AJ刊源
山西省一级期刊
国外数据库收录：
CA 化学文摘(美)(2011)
期刊荣誉：
Caj-cd规范获奖期刊
基于生物信息学方法对抑郁小鼠长期服用氟西汀后差异基因表达的分析
作 者： 高丽娟 [1] 李建国
关键词： GEO数据库 抑郁症 生物信息学
摘 要：目的 以GEO数据库中GSE6476系列芯片数据为分析对象,结合生物信息学方法分析氟西汀长期作用下抑郁小鼠海马相关基因的表达情况 方法 利用R语言与Bioconductor、DAVID、STRING、Uniprot等方法对差异基因进行了筛选和分析 结果 得到144个差异基因,其中上调基因111个,下调基因33个(logFC＞1,P＜0 05) 经GO分析发现这些差异基因中有14个参与生物过程(BP),16个参与细胞组成(CC),9个参与分子功能(MF) Pathway通路分析发现,差异基因主要集中在甘油酯代谢、N-聚糖的生物合成、精氨酸和脯氨酸代谢途径、花生四烯酸代谢、甘油磷脂代谢、氧化磷酸化等通路,进一步分析,78个差异基因的蛋白产物间存在相互作用,并筛选到Vim、Bdnf、Npy、Gfap、Penk、Fosb、Cd44、Timpl、Lgalsl等核心基因,这些基因在神经肽信号通路、女性妊娠、树突和神经发育等生物功能中充当了重要的角色 结论 氟西汀长期作用前后抑郁小鼠海马基因表达有较大差异性,通过核心基因的筛选为揭示抑郁症的基因靶向治疗指导提供了重要的理论基础
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